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生命的本质是遗传信息在生命周期中的有序存储、读取和传递。 编码遗传信息的DNA并非在细胞核内随机分布,而是折叠为高度凝缩的染色质,而染色质又折叠成一系列复杂但有序的高维结构,这些高维结构可以调控基因的时空表达模式,进而影响细胞的生理功能与命运。通过揭示基因组在细胞核内的空间组织,将“一维”的DNA序列信息与三维基因组结构特征进行整合,我们可以从系统水平上深入理解基因组运行的机制,从而更好地理解发育、衰老和疾病发生发展过程中复杂生物学性状的来源,是当前遗传学领域的前沿研究方向。

卞迁课题组以小鼠、秀丽隐杆线虫、胚胎干细胞为模型,综合利用高通量染色质构象捕获(Hi-C)、单细胞转录谱分析、ChIP-Seq等多基因组学技术,结合高分辨率显微成像及基因编辑等方法,研究在全生命周期中基因组的调控规律。我们的研究方向致力于理解以下三个层次的科学问题:1)真核生物的三维基因组结构有哪些特征,在生命过程中出现哪些动态变化? 2) 调控三维基因组结构建立、维持及动态变化的关键因子和分子机制为何?3)三维基因组结构如何影响转录调控,进而影响真核生物的发育与衰老?

目前实验室在国家自然科学基金及科技部重点研发计划的资助下,主要开展以下几个方面的研究:
1. 增强子等非编码元件在组织器官发育和形态发生中的功能和作用机制。
2. 衰老与应激反应中的三维基因组结构和表观遗传调控机制。
3. Cohesin/CTCF以外的三维基因组结构调控因子及其作用机制。